MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 chromosome

Total Repeats: 9335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017492	AT	3	6	40	45	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017492	T	6	6	87	92	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017492	T	7	7	95	101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017492	A	6	6	195	200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017492	T	6	6	201	206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017492	TAA	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017492	TGG	2	6	244	249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017492	CTTT	2	8	254	261	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017492	CAA	2	6	317	322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017492	CTA	3	9	1816	1824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017492	TAT	2	6	1829	1834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017492	T	6	6	3107	3112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017492	GGA	2	6	10039	10044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017492	ACT	2	6	10980	10985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017492	ATT	2	6	11030	11035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017492	TAAT	2	8	11069	11076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017492	AAATG	2	10	12223	12232	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017492	CAAA	2	8	12282	12289	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017492	A	7	7	12287	12293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017492	AAGG	2	8	12315	12322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017492	AAG	2	6	12756	12761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017492	TAA	2	6	12768	12773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017492	A	10	10	12809	12818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017492	TGA	2	6	12819	12824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017492	ATT	2	6	12830	12835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017492	TA	3	6	12926	12931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017492	TAGA	2	8	13885	13892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017492	T	8	8	13927	13934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017492	CTC	2	6	13936	13941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017492	TAAA	2	8	13946	13953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017492	TAA	2	6	13961	13966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017492	TTA	2	6	14005	14010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017492	GAAAA	2	10	14022	14031	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017492	T	6	6	18140	18145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017492	ATC	2	6	18685	18690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017492	TCT	2	6	19444	19449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017492	ATT	2	6	19453	19458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017492	ACA	2	6	19520	19525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017492	ATT	2	6	19529	19534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017492	GAAT	2	8	19540	19547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017492	A	6	6	22731	22736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017492	TACT	2	8	22748	22755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017492	TTA	2	6	22820	22825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017492	AAG	2	6	22837	22842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017492	TAA	3	9	22860	22868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017492	T	8	8	24990	24997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017492	AAT	2	6	25007	25012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017492	A	6	6	25033	25038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017492	TAT	2	6	25039	25044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017492	GAC	2	6	25074	25079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017492	TTA	2	6	25088	25093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017492	AT	3	6	25102	25107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017492	A	7	7	25141	25147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017492	ATA	2	6	25159	25164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017492	CAA	2	6	25188	25193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017492	CGG	2	6	25236	25241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017492	GGA	2	6	25276	25281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017492	GCGT	2	8	25335	25342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017492	TCC	2	6	25359	25364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017492	AGC	2	6	25386	25391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017492	TCG	2	6	25400	25405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017492	CGG	2	6	25502	25507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017492	CTTAA	2	10	25608	25617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017492	AAGTC	2	10	25749	25758	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017492	GTA	2	6	25840	25845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017492	ATG	2	6	25863	25868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017492	T	7	7	25919	25925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017492	TAA	2	6	25942	25947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017492	TTTA	2	8	25977	25984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017492	GATT	2	8	27875	27882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017492	CAAAA	2	10	27908	27917	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017492	ACG	2	6	29867	29872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017492	GAA	2	6	29901	29906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017492	A	7	7	30352	30358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017492	T	6	6	30379	30384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017492	ACC	2	6	30391	30396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017492	AGA	2	6	30437	30442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017492	TAAA	2	8	30466	30473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017492	AGTA	2	8	30479	30486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017492	TC	3	6	31451	31456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017492	TTG	2	6	31477	31482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017492	AGTC	2	8	31515	31522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017492	GAA	2	6	31572	31577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017492	A	7	7	31596	31602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017492	A	8	8	31712	31719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017492	TTA	2	6	31731	31736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017492	T	7	7	31778	31784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017492	CGAA	2	8	31842	31849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017492	GGA	2	6	31911	31916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017492	T	7	7	31938	31944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017492	T	6	6	31977	31982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017492	A	6	6	31996	32001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017492	CCA	2	6	32008	32013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017492	TA	3	6	32028	32033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017492	A	6	6	32036	32041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017492	T	6	6	32088	32093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017492	TAA	2	6	32102	32107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017492	AAT	2	6	32108	32113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017492	GA	3	6	32132	32137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017492	A	6	6	32187	32192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017492	A	7	7	32200	32206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017492	T	8	8	32228	32235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017492	ATG	2	6	32247	32252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017492	T	6	6	32269	32274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017492	A	6	6	32295	32300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017492	ATC	2	6	33091	33096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017492	TAA	2	6	33098	33103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017492	ATT	2	6	33106	33111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017492	T	7	7	33110	33116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017492	TAG	2	6	33178	33183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017492	TTC	2	6	34397	34402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017492	ATT	2	6	34428	34433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017492	T	6	6	34446	34451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017492	TAATAT	2	12	34469	34480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017492	T	6	6	34488	34493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017492	ATT	2	6	34526	34531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017492	TAT	2	6	34590	34595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017492	TG	3	6	34622	34627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017492	ATA	2	6	34628	34633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017492	TCA	2	6	34692	34697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017492	ATT	2	6	34714	34719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017492	AGT	2	6	34739	34744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017492	ATA	2	6	34827	34832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017492	AAG	2	6	34887	34892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017492	AAG	2	6	34949	34954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017492	AAT	2	6	34974	34979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017492	TA	3	6	35070	35075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017492	A	6	6	35091	35096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017492	ACT	2	6	35481	35486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017492	CTA	2	6	35524	35529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017492	TCA	2	6	35536	35541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017492	ATT	2	6	35591	35596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017492	TGAAAA	2	12	35823	35834	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017492	GGGA	2	8	35862	35869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017492	ATT	2	6	36209	36214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017492	A	8	8	36244	36251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017492	TGA	2	6	36257	36262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017492	AAGA	2	8	36298	36305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017492	GTT	2	6	36312	36317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017492	AAT	2	6	36364	36369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017492	TAA	2	6	36389	36394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017492	TTTTAA	2	12	36413	36424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017492	AAT	2	6	36444	36449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017492	TTC	2	6	36454	36459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017492	TGT	2	6	36464	36469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017492	AT	3	6	36493	36498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017492	TATATT	2	12	36579	36590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017492	T	7	7	36599	36605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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